テクノロジー及びシステム概要
スタンフォード大学のDr. Garry Nolanの研究室で開発されたCO-Detection by indEXing技術は、多種類のオリゴヌクレオチドからなるバーコードが結合した抗体を用います。この技術により、カスタマイズ可能な40種類以上の抗体パネルを1度の組織染色反応で組み合わせることができます。
この技術を実行する自動送液制御装置がPhenoCyclerTM(旧名：CODEX)になります。この装置は、繰り返しイメージングサイクルを自動で制御します。1回のサイクルで、それぞれスペクトルの異なる色素を持つ3種のレポーターを染色した組織に加え、それぞれに結合する抗体バーコードで検出します。従って1度のサイクルで3種の抗体での画像が得られ、その工程が自動で異なる3種の抗体で繰り返されます。
この各サイクルで得られる画像を超高速で取得し自動高速解析を行う装置がFusionになります。約10分間で100万個の細胞をマッピングできお客様の研究を飛躍的に加速します。
＊製品カタログやアプリケーションノートなど本ページの下部にあります。是非ご覧ください。
・完全自動でのハイスループット細胞マッピング
完全自動で各サイクル毎に3種のレポーター・蛍光を送液・反応し画像を取得。このサイクルを繰り返すことで40種以上のマーカー画像をシングルセル単位で取 得。
・40種以上のバイオマーカー検出
形態学的環境でのSpatial解析とウルトラ・ハイプレックスデータの取得。
・豊富な検証済みの抗体パネル
ヒト及びマウス組織用の多種類の検証済み抗体パネルを提供すると共に、お客様独自のパネルを
作成するためのConjugationキットも提供。
・完全な組織形態を維持
高度な送液技術と組み合わせたケミストリーは、サンプルの組織構造を維持し再利用が可能。
・コンパクトなシステム
コンパクトな設計で、完全に自動化された操作
PhenoCycler™用ハイパフォーマンス検出解析装置：Fusion
約10分で100万個の細胞をマッピングを可能とする、高性能のシングルセルSpatial解析システムです。
通常のスライドガラスが使用でき、スライド全体を超高速でイメージングします。セルアトラスの構築、新規の細胞型の発見、Spatialフェノタイピング特性の解明など、PhenoCycler (旧名CODEX) - Fusion システムは、お客様の研究を強力に支援します。
詳細は以下のビデオでご確認ください。
システム・ワークフロー
ケミストリー概要
基本ケミストリー : 各イメージングサイクル中に、3種のレポーターが、抗体に結合した対応するバーコード に対して相補結合されます。 各バイオマーカーについて蛍光シグナルが検出されます。
サイクル・ワークフローの概略図 : システム では、独自のオリゴヌクレオチド・バーコードが結合した抗体を使用します。染色 は、最大50個のカスタマイズ可能な抗体を使用して1ステップで実行されます。その後、PhenoCycler流体制御システムで繰り返されるサイクル毎にスペクトルの異なる色素 を含む3種のレポーターがサンプルに加えられ、Fusionでイメージング処理し解析されます。
PhenoCycler-Fusionシステムで得られた部位およびシングルセル単位でのSpacialバイオロジーデータ。 左：ケラチノサイト構造の領域差は、システムにより大きな組織でのウルトラ・マルチプレックスイメージングにより簡単に 解析されます。 右：真のシングルセル分解能により、核膜（LaminB1）や原形質膜（e-カドヘリン）などの細胞内成分の可視化が可能になります。
シングルセルレベルでのさまざまな細胞タイプの生物学的相互作用の解析結果（ 肺癌組織での例 )
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